IFCD007PO BIOINFORMÁTICA APLICADA AL DESARROLLO DE MEDICAMENTOS

UNIDAD DIDÁCTICA 1. INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA.

1. Intentando definir la bioinformática.
2. Relevancia actual de la bioinformática.
3. Formatos de ficheros y bases de datos.
4. Proveedores institucionales de datos.
5. Herramientas locales y de internet.

UNIDAD DIDÁCTICA 2. HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES.

1. Sistemas operativos alternativos: introducción a Unix/Linux.
2. Órdenes en línea de comandos y filosofía de órdenes encadenadas (pipes).
3. Lenguajes de programación: Perl como ejemplo.
4. Estructuras de datos, entrada/salida y funciones en Perl.
5. Herramientas estadísticas: R como ejemplo.
6. Librerías específicas de bioinformática: Bioconductor como ejemplo.
7. Gestores de bases de datos: SQL como ejemplo.
8. Detrás de las páginas web: HTML, Formularios, CGI, PHP, gestores de contenidos.

UNIDAD DIDÁCTICA 3. ALGORITMOS.

1. Búsqueda de patrones en secuencias.
2. Alineamiento de secuencias: Dotplots y programación dinámica.
3. Algoritmos heurísticos: FastA, BLAST y Clustal.

UNIDAD DIDÁCTICA 4. BIOINFORMÁTICA APLICADA.

1. Análisis de secuencias genómicas (FastA y BLAST).
2. Más allá de BLAST: Prosite (búsqueda de patrones).
3. Transcriptómica (microarrays y qRT-PCR).
4. Minería en datos masivos (high throughput screening).
5. Biología de sistemas: Gene Ontology database (GO).
6. Análisis de la variación (polimorfismos).
7. Análisis de las relaciones evolutivas (filogenias).
8. Biología estructural tridimensional: PDB.